MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013740	CT	3	6	23108	23113	0 %	50 %	0 %	50 %	284047408
502	NC_013740	GGC	2	6	23209	23214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047408
503	NC_013740	ATT	2	6	23335	23340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047408
504	NC_013740	TCA	2	6	23365	23370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047408
505	NC_013740	GGA	2	6	23389	23394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047408
506	NC_013740	AAAG	2	8	23420	23427	75 %	0 %	25 %	0 %	284047408
507	NC_013740	TACC	2	8	23435	23442	25 %	25 %	0 %	50 %	284047408
508	NC_013740	TGA	2	6	23461	23466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047408
509	NC_013740	ATG	2	6	23512	23517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047408
510	NC_013740	AAC	2	6	23568	23573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047408
511	NC_013740	TG	3	6	23600	23605	0 %	50 %	50 %	0 %	284047408
512	NC_013740	A	6	6	23610	23615	100 %	0 %	0 %	0 %	284047408
513	NC_013740	CTA	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047408
514	NC_013740	A	6	6	23679	23684	100 %	0 %	0 %	0 %	284047408
515	NC_013740	C	6	6	23766	23771	0 %	0 %	0 %	100 %	284047409
516	NC_013740	CCG	2	6	23825	23830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047409
517	NC_013740	CAG	2	6	23858	23863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047409
518	NC_013740	AGC	2	6	23901	23906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047409
519	NC_013740	GCA	3	9	23914	23922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047409
520	NC_013740	TGGC	2	8	23932	23939	0 %	25 %	50 %	25 %	284047409
521	NC_013740	AGC	2	6	23940	23945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047409
522	NC_013740	CAG	2	6	23951	23956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047409
523	NC_013740	CAG	2	6	23960	23965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047409
524	NC_013740	CTG	3	9	24107	24115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047409
525	NC_013740	CCG	2	6	24220	24225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047409
526	NC_013740	TG	3	6	24266	24271	0 %	50 %	50 %	0 %	284047409
527	NC_013740	CTG	2	6	24305	24310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047409
528	NC_013740	AGCC	2	8	24320	24327	25 %	0 %	25 %	50 %	284047409
529	NC_013740	GCT	3	9	30165	30173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047410
530	NC_013740	TGG	2	6	30191	30196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047410
531	NC_013740	GTG	2	6	30304	30309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047410
532	NC_013740	CTG	2	6	30316	30321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047410
533	NC_013740	T	6	6	30382	30387	0 %	100 %	0 %	0 %	284047411
534	NC_013740	T	6	6	30417	30422	0 %	100 %	0 %	0 %	284047411
535	NC_013740	GA	3	6	30440	30445	50 %	0 %	50 %	0 %	284047411
536	NC_013740	CCGAT	2	10	30507	30516	20 %	20 %	20 %	40 %	284047411
537	NC_013740	CAG	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047411
538	NC_013740	TCC	2	6	30616	30621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047411
539	NC_013740	TTC	2	6	30627	30632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047411
540	NC_013740	GCCA	2	8	30643	30650	25 %	0 %	25 %	50 %	284047411
541	NC_013740	GGTCCA	2	12	30764	30775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284047411
542	NC_013740	ACA	2	6	30800	30805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047411
543	NC_013740	GGC	2	6	30854	30859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047411
544	NC_013740	GCCG	2	8	30896	30903	0 %	0 %	50 %	50 %	284047411
545	NC_013740	GCG	2	6	31176	31181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047412
546	NC_013740	TTCTT	2	10	31272	31281	0 %	80 %	0 %	20 %	284047412
547	NC_013740	GAA	2	6	31310	31315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047412
548	NC_013740	CGG	3	9	31345	31353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047412
549	NC_013740	TTG	2	6	31362	31367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047412
550	NC_013740	TGA	2	6	31378	31383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047412
551	NC_013740	GGC	2	6	31400	31405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047412
552	NC_013740	GTT	2	6	31478	31483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047412
553	NC_013740	AGGT	2	8	31488	31495	25 %	25 %	50 %	0 %	284047412
554	NC_013740	TTC	2	6	31520	31525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047412
555	NC_013740	ATA	2	6	31577	31582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284047412
556	NC_013740	CGG	2	6	31840	31845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047413
557	NC_013740	T	6	6	31898	31903	0 %	100 %	0 %	0 %	284047413
558	NC_013740	CAT	3	9	31913	31921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047413
559	NC_013740	CTG	2	6	31923	31928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047413
560	NC_013740	TCA	2	6	32005	32010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047413
561	NC_013740	AGA	2	6	32027	32032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047413
562	NC_013740	GAA	2	6	32055	32060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047413
563	NC_013740	GAT	2	6	32081	32086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047413
564	NC_013740	AGC	2	6	32155	32160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047413
565	NC_013740	GCT	2	6	32273	32278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047413
566	NC_013740	GAA	2	6	32295	32300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047413
567	NC_013740	GAA	2	6	32303	32308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047413
568	NC_013740	A	6	6	32526	32531	100 %	0 %	0 %	0 %	284047414
569	NC_013740	GAA	2	6	32533	32538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047414
570	NC_013740	CAA	2	6	32581	32586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047414
571	NC_013740	CGGGCA	2	12	32682	32693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284047414
572	NC_013740	CTG	2	6	32714	32719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
573	NC_013740	TGGA	2	8	32724	32731	25 %	25 %	50 %	0 %	284047414
574	NC_013740	GAT	2	6	32737	32742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047414
575	NC_013740	CTC	2	6	32778	32783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047414
576	NC_013740	TG	3	6	32801	32806	0 %	50 %	50 %	0 %	284047414
577	NC_013740	A	6	6	32826	32831	100 %	0 %	0 %	0 %	284047414
578	NC_013740	AGA	2	6	32856	32861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047414
579	NC_013740	CGGCTC	2	12	32874	32885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284047414
580	NC_013740	TGC	2	6	32952	32957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
581	NC_013740	GCC	3	9	33101	33109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047414
582	NC_013740	CAG	2	6	33131	33136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047414
583	NC_013740	TAT	2	6	33152	33157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047414
584	NC_013740	TGG	2	6	33162	33167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047414
585	NC_013740	CTG	2	6	33179	33184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
586	NC_013740	A	6	6	33210	33215	100 %	0 %	0 %	0 %	284047414
587	NC_013740	GGC	2	6	33298	33303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047414
588	NC_013740	TGG	2	6	33339	33344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047414
589	NC_013740	CTG	2	6	33353	33358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
590	NC_013740	CAT	2	6	33403	33408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047414
591	NC_013740	CAT	2	6	33436	33441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047414
592	NC_013740	GCTTC	2	10	33486	33495	0 %	40 %	20 %	40 %	284047414
593	NC_013740	TTC	2	6	33556	33561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047414
594	NC_013740	CTG	2	6	33569	33574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
595	NC_013740	CTT	2	6	33577	33582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047414
596	NC_013740	ATC	2	6	33689	33694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047414
597	NC_013740	ATG	3	9	33782	33790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047414
598	NC_013740	TAT	2	6	33872	33877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047414
599	NC_013740	CAT	2	6	33934	33939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047414
600	NC_013740	TGC	2	6	33948	33953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
601	NC_013740	CTG	2	6	33989	33994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047414
602	NC_013740	GGT	2	6	34003	34008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047414
603	NC_013740	CGG	3	9	34030	34038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047414
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605	NC_013740	GAA	2	6	34702	34707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047415
606	NC_013740	A	7	7	34706	34712	100 %	0 %	0 %	0 %	284047415
607	NC_013740	CAC	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047415
608	NC_013740	GCG	2	6	34729	34734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047415
609	NC_013740	TGCCC	2	10	34851	34860	0 %	20 %	20 %	60 %	284047415
610	NC_013740	AGG	2	6	34865	34870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047415
611	NC_013740	CATG	2	8	34911	34918	25 %	25 %	25 %	25 %	284047415
612	NC_013740	CTG	2	6	35008	35013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047415
613	NC_013740	GAA	2	6	35026	35031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047415
614	NC_013740	GAT	2	6	35074	35079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047415
615	NC_013740	GCAT	2	8	35096	35103	25 %	25 %	25 %	25 %	284047415
616	NC_013740	CTG	2	6	35113	35118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047415
617	NC_013740	ACCCTT	2	12	35176	35187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	284047415
618	NC_013740	GGC	3	9	35238	35246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047415
619	NC_013740	CAG	2	6	35269	35274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047415
620	NC_013740	GAT	2	6	35325	35330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047415
621	NC_013740	GTCC	2	8	35364	35371	0 %	25 %	25 %	50 %	284047415
622	NC_013740	TGG	2	6	35375	35380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047415
623	NC_013740	CAC	2	6	35382	35387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047415
624	NC_013740	CAA	2	6	35397	35402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047415
625	NC_013740	GCCC	2	8	35499	35506	0 %	0 %	25 %	75 %	284047415
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882	NC_013740	A	6	6	48646	48651	100 %	0 %	0 %	0 %	284047423
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